Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ6

TXNRD3, Thioredoxin reductase 3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3Q86VQ6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TXNRD3Q86VQ6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms