Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8AQ86V59 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8AQ86V59 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8AQ86V59 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8AQ86V59 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8AQ86V59 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8AQ86V59 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8AQ86V59 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8AQ86V59 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8AQ86V59 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8AQ86V59 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8AQ86V59 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8AQ86V59 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8AQ86V59 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8AQ86V59 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNMA8AQ86V59 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA8AQ86V59 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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