Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHMP1BQ7LBR1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms