Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP34Q70CQ2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms