Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BEND4Q6ZU67 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms