Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CFAP47Q6ZTR5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CFAP47Q6ZTR5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
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