Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

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Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBR3Q6ZT12 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
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