Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TTC41PQ6P2S7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTC41PQ6P2S7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms