Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LETMD1Q6P1Q0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms