Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDD2Q6NTF9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RHBDD2Q6NTF9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms