Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NANOGP8Q6NSW7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NANOGP8Q6NSW7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms