Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GKAP1Q5VSY0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms