Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q5VSD8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q5VSD8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q5VSD8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q5VSD8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Q5VSD8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms