Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PXDC1Q5TGL8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms