Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms