Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP78Q5JTW2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP78Q5JTW2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms