Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TDRD12Q587J7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms