Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC93Q567U6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms