Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms