Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
KRTAP13-3Q3SY46 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms