Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL40Q2TBA0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms