Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNRD1Q16881 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNRD1Q16881 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNRD1Q16881 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms