Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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PTPROQ16827 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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PTPROQ16827 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PTPROQ16827 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PTPROQ16827 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PTPROQ16827 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PTPROQ16827 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPROQ16827 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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