Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP7Q16576 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBBP7Q16576 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms