Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAMK4Q16566 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms