Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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SSX1Q16384 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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SSX1Q16384 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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SSX1Q16384 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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SSX1Q16384 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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SSX1Q16384 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSX1Q16384 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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SSX1Q16384 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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SSX1Q16384 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
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