Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIP13Q15645 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms