Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCEA2Q15560 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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