Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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