Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD1Q15116 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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