Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NCAPHQ15003 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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