Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GAPVD1Q14C86 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
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