Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNB1Q14721 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms