Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMC1AQ14683 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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