Protein–RNA interactions for Protein: Q14669

TRIP12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP12Q14669 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIP12Q14669 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIP12Q14669 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms