Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEMA3AQ14563 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3AQ14563 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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