Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCARF1Q14162 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCARF1Q14162 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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