Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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COL4A6Q14031 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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COL4A6Q14031 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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COL4A6Q14031 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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COL4A6Q14031 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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COL4A6Q14031 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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COL4A6Q14031 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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COL4A6Q14031 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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COL4A6Q14031 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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COL4A6Q14031 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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COL4A6Q14031 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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COL4A6Q14031 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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