Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CKAP5Q14008 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CKAP5Q14008 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CKAP5Q14008 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CKAP5Q14008 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CKAP5Q14008 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CKAP5Q14008 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CKAP5Q14008 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CKAP5Q14008 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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