Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CUL4BQ13620 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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