Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CUL3Q13618 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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