Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PICALMQ13492 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms