Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MKRN4PQ13434 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms