Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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SP140Q13342 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SP140Q13342 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP140Q13342 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP140Q13342 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP140Q13342 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP140Q13342 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP140Q13342 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP140Q13342 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP140Q13342 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP140Q13342 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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SP140Q13342 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP140Q13342 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP140Q13342 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP140Q13342 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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SP140Q13342 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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SP140Q13342 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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SP140Q13342 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SP140Q13342 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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SP140Q13342 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SP140Q13342 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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SP140Q13342 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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SP140Q13342 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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SP140Q13342 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP140Q13342 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP140Q13342 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP140Q13342 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP140Q13342 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP140Q13342 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP140Q13342 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP140Q13342 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP140Q13342 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP140Q13342 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP140Q13342 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP140Q13342 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SP140Q13342 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SP140Q13342 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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