Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RIGQ13278 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
RIGQ13278 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
RIGQ13278 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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