Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD2Q13200 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD2Q13200 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD2Q13200 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD2Q13200 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD2Q13200 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD2Q13200 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD2Q13200 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD2Q13200 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD2Q13200 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD2Q13200 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD2Q13200 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD2Q13200 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD2Q13200 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD2Q13200 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD2Q13200 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD2Q13200 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD2Q13200 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms