Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IFT88Q13099 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT88Q13099 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms