Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRDNQ13061 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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