Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HSPB3Q12988 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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