Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFX1Q12986 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NFX1Q12986 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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